La cantidad de daños sufridos por Azerbaiyán durante la Primera Guerra del Karabaj fue inmensa. De 1988 a 1994, las fuerzas militares armenias saquearon y destruyeron aproximadamente 900 pueblos azerbaiyanos, ocuparon el 20% del territorio de Azerbaiyán, mataron a más de 20.000 personas e hirieron o lesionaron a más de 50.000 azerbaiyanos, que quedaron discapacitados y lisiados permanentemente. Varios miles de azerbaiyanos siguen desaparecidos. Durante esos años, las palizas, la tortura y el trato cruel e inhumano de los prisioneros de guerra y los civiles fueron la norma, al igual que el empleo forzoso de azerbaiyanos en los trabajos más difíciles en Armenia y los territorios ocupados.542
La agresión armenia también dañó el tejido socioeconómico de Azerbaiyán. Según el Ministerio de Asuntos Exteriores de Azerbaiyán, los daños socioeconómicos causados por la guerra son los siguientes:
La magnitud de los daños sufridos por los bienes culturales de Azerbaiyán también fue enorme. Durante la agresión, los armenios destruyeron objetos del patrimonio cultural azerbaiyano en territorios ocupados. Saquearon un gran número de monumentos y obras maestras históricas, culturales, humanitarias y religiosas, que luego vendieron en subasta y en tiendas de distintos países. Los agresores armenios también saquearon y destruyeron varios museos históricos de la región, como el Museo de Historia de la región de Kalbajar, que poseía colecciones únicas de monedas antiguas, objetos de oro y plata, piedras raras y preciosas, alfombras y diversos artículos hechos a mano, el Museo de Historia de la ciudad de Shusha, un Museo del Pan único en la ciudad de Aghdam y el Museo de Monumentos de Piedra. Además de los museos, más de 500 monumentos históricos y arquitectónicos, 100 yacimientos arqueológicos, 22 museos con 40.000 objetos expuestos, 9 palacios, 44 templos, 10 mezquitas, 4 galerías de arte y cientos de antiguos mausoleos y fortalezas resultaron dañados o destruidos durante la ofensiva armenia. La famosa mezquita de Govhar Aga, en la región de Shusha, construida en el siglo XVIII, y otras mezquitas del territorio bajo control armenio fueron destruidas, incendiadas o utilizadas como almacenes y depósitos. Las fuerzas armadas armenias y los separatistas también saquearon yacimientos únicos de la Edad de Bronce: más de 10 túmulos en el campo de túmulos de Khojaly, que ocupa una superficie de 50 hectáreas. Los ocupantes también transformaron la cueva de Azikh, uno de los asentamientos prehistóricos más antiguos de la humanidad, situado en la región ocupada de Fuzuli, en Azerbaiyán, en un depósito 545.
La magnitud del desastre ecológico fue enorme. Como consecuencia de la ocupación armenia, el sistema de riego y abastecimiento de agua de la región y sus alrededores quedó interrumpido. Las fuerzas armenias también se apoderaron de 280.000 hectáreas de bosques, lo que equivale al 25% de la superficie forestal de Azerbaiyán, 2 parques nacionales y 4 reservas naturales nacionales. Además, 200 fósiles naturales, fauna y monumentos geológicos estaban bajo control de las fuerzas armenias. Se destruyeron 800 km. de comunicaciones por ferrocarril y carretera y 15 km. de líneas eléctricas y de gas. Los armenios también destruyeron el sistema de riego y comunicaciones por agua, de 1.203 km, que incluía cinco embalses con una capacidad total de 674 millones de metros cúbicos, 7.296 instalaciones hidráulicas, 36 estaciones de bombeo y 26 sistemas de riego. Además, volaron 160 puentes con una longitud total de 3.834 metros. Se destruyeron 800 km. de carreteras, 2.300 km. de tuberías de agua y 2.000 km. de alcantarillas.546
Armenia también dañó los recursos hídricos de Azerbaiyán. Así, alrededor de “2,1 millones de m3 de agua contaminada se vierten sin depuración previa en el Aras, en primer lugar en sus afluentes, que discurren por el territorio de Armenia y los territorios ocupados de Azerbaiyán cada día”.547
Las tierras ocupadas también poseen varios ricos yacimientos minerales: 2 de oro, 4 de mercurio, 2 de cromita, 1 de plomo-zinc, 1 de cobre y 1 de antimonio. Los armenios explotaron ilegalmente estos yacimientos, lo que supuso una clara violación de las normas y principios internacionales. Un acto ilegal de Armenia en las tierras ocupadas de Azerbaiyán fue la firma de un acuerdo con la empresa canadiense First Dynasty Mines para explotar conjuntamente el yacimiento de oro de Soyudlu, en la región de Kalbajar. Armenia recibió anualmente unas 13 toneladas de oro de este yacimiento hasta la liberación de los territorios ocupados como consecuencia de la Segunda Guerra de Karabaj.548
En consecuencia, según el Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo (PNUD), el coste material total y los daños económicos causados por la agresión armenia se estiman en unos 53.500 millones de dólares estadounidenses.549 Debido a esta pérdida económica en la región ocupada de Azerbaiyán, cerraron casi 7.000 establecimientos, que en conjunto proporcionaban el 24% de los ingresos por cereales de Azerbaiyán, el 41% de su producción de licor, el 46% de la cosecha de patatas, el 18% de la producción de carne y el 34% de la producción de leche.550