Hay diferentes años de fundación de la fortaleza de Shusha en los libros de Karabajnames. Las fechas indicadas por los autores de los libros sobre la fundación de la fortaleza no coinciden con los acontecimientos históricos de la época 119 . Por ejemplo, a este respecto, Mirza Adigozel bey escribe que Panah Ali Khan había construido una gran fortaleza que contenía casas principales y trasladó allí el centro del kanato en 1756/57. Demostró que Muhammad Hasan Khan Qajar atacó Karabaj un año después.120. Sin embargo, cabe señalar que, según las fuentes históricas, el ataque de Muhammad Hasan Khan Qajar contra Karabaj no se produjo en 1757, sino a finales de 1751.121 En el libro «Historia de la ciudad de Shusha», escrito por Hasan Ikhfa Alizade, se ofrece información precisa sobre la fecha de fundación de la fortaleza de Shusha. Según el autor, la fortaleza fue construida en 1750-1751,122 una fecha que muchos otros historiadores también aceptan.123 En cuanto a la fecha (1756/57) dada en la información mencionada anteriormente en Karabajnames sobre la fundación de la fortaleza de Shusha, es posible argumentar que estas fechas estaban relacionadas con el asentamiento de la población de las regiones circundantes en la Fortaleza. Por lo tanto, algunos historiadores creen que la fortaleza de Shusha se fundó en 1750-1756.

La nueva fortaleza contenía varias mezquitas, baños, bazares y casas, y se llamó «Panahabad» en honor de Panah Ali Khan, fundador del kanato de Karabaj 124 . Sin embargo, fue rebautizada Shusha durante el reinado de Ibrahimkhalil Khan, hijo de Panah Ali Khan. Según las fuentes históricas el lugar donde Panah Ali Khan fundó la fortaleza de Shusha anteriormente eran praderas y pastizales del antiguo asentamiento humano que estaba situado a 6 km de la Fortaleza y llamado Shishekend (aldea de Shishe) por la población local.125 Por lo tanto, incluso después de la fundación de la fortaleza de Panahabad, este lugar fue llamado el territorio de la aldea de Shishe (Sh[ü]she). Durante el reinado de Ibrahimkhalil Khan, la fortaleza fue descrita como el territorio de Shüshe. Más tarde, la Rusia zarista adaptó el nombre al dialecto ruso y se pronunció Shusha.126 También es posible ver la transformación de la palabra Shüshe en Shusha en documentos de archivo del Imperio Otomano. El nombre se registró inicialmente como Shüshe en los documentos otomanos 127 y después como Shusha.128

Los muros de la fortaleza de Shusha, construidos con fines defensivos, miden unos 8 km, 5 metros de altura y más de 2 metros de grosor. Se construyeron con piedras densas y cal para proteger la fortaleza de la artillería. Inicialmente, la fortaleza tenía cuatro puertas, pero una de ellas se cerró más tarde. La puerta que se utilizaba para los coches de caballos era la entrada principal de la fortaleza. Las otras dos puertas se utilizaban como puntos secretos de entrada y salida durante las guerras y los conflictos armados.  Estas puertas daban al norte y oeste y se llamaban Ganyá-Chilabord y Revan, respectivamente.129

La fortaleza de Shusha ocupa un lugar importante en la arquitectura de Karabaj. La fortaleza estaba situada a 1400 metros por encima del nivel del mar, y había aproximadamente 300 metros de diferencia de altura entre las mahallas (barrios/distritos) superior e inferior de la misma. Según la investigación de Hasan Ikhfa Alizade sobre la arquitectura de la fortaleza de Shusha, la mayoría de los monumentos históricos y arqueológicos del Kanato de Karabaj fueron grabados y se derrumbaron con el tiempo. Aunque cada barrio de la fortaleza de Shusha tenía su mezquita durante el Kanato de Karabaj y la Rusia zarista, sólo una mezquita, el palacio de justicia y el gran caravasar de la fortaleza conservaron su existencia hasta los tiempos modernos.130 Por su parte, Baharli, en su obra «Ahvalat-e Karabakh» (Una historia de Karabaj), afirma que 18 casas de baños y 8 caravasares funcionaron en Shusha hasta el final del kanato de Karabaj.131

Para construir la fortaleza de Shusha se utilizaron principalmente piedras y ladrillos. Piedras para los muros de la fortaleza y las mezquitas, baños y bazares.  En cambio, los ladrillos se utilizaron sobre todo para construir casas y apartamentos. La fortaleza se construyó según la arquitectura antigua e histórica de Azerbaiyán. Durante la construcción de la fortaleza de Shusha, Panah Ali Khan invitó a arquitectos especiales y maestros artesanos de Tabriz, Ardabil y otras ciudades de Azerbaiyán 132. También se puede ver el estilo arquitectónico azerbaiyano, que ocupa un lugar importante en la cultura turco-islámica, predomina en los monumentos arquitectónicos de la fortaleza de Shusha.

A finales del siglo XVIII, la ciudad de Shusha constaba de 17 mahallas (barrio/distrito) que se dividían en mahalas superiores e inferiores. Las mahallas inferiores de la ciudad eran Gurdlar, Seyidli, Julfalar, Toylug (Guyulug), Chukhur, Dordler Gurdu, Haji Yusifi, Dord Chinar və Chol Gala, y las mahallas superiores eran Mir-Khanlıg, Saatli, Kocherli, Mamayı, Khoja Marjanli, Damirchi, Hamam Gabaghı və Taza mahalla.133 Según fuentes históricas, a finales del siglo XVIII vivían en estas mahallas 2.000 familias (unas 10.000 personas). Tras la incorporación del kanato de Karabaj a la Rusia zarista en 1805, se construyó una tercera mahalla, llamada Gazanchali, en la parte montañosa de la ciudad de Shusha. Esta mahalla se amplió posteriormente y constaba de 12 calles a lo largo del siglo XIX.134  Según Baharli, cronógrafo de Karabaj, la principal población musulmana de Shusha vivía en las mahallas superior e inferior.135 La mahalla de Gazanchali estaba poblada principalmente por la población no musulmana de Shusha, a saber, armenios y rusos que se asentaron en Karabaj tras la ocupación del Imperio zarista. A finales del siglo XIX, la población de Shusha disminuyó en aproximadamente dos o tres mil personas debido a la emigración de la población local a Irán y otras partes de Azerbaiyán como consecuencia de la guerra (1797) entre el kanato de Karabaj y Agha Muhammad Shah Qajar, el Shah de Irán, así como de la ocupación del kanato por el Imperio zarista. Estos territorios abandonados de Karabaj fueron poblados por no musulmanes como resultado de la política migratoria del Imperio zarista.136 En consecuencia, la población no musulmana de Karabaj aumentó durante el siglo XIX, mientras que el porcentaje de población azerbaiyana disminuyó.