Como resultado de la política migratoria del Imperio zarista, la población armenia de los imperios otomano y persa se asentó a principios del siglo XIX en la parte septentrional de Azerbaiyán, principalmente en Karabaj, Iraván, Ganyá y Najicheván, lo que influyó drásticamente en la situación demográfica de estas regiones. La principal intención de la política migratoria del Imperio zarista era cumplir su promesa de crear un Estado armenio en esta parte de Azerbaiyán,189 lo que también estaba previsto en el decreto de Pedro I promulgado el 10 de noviembre de 1724. La creación de la provincia armenia y la guberniya de Iraván por el Imperio zarista, respectivamente en 1828 y 1848, fue un paso significativo en la realización de esta promesa del Imperio zarista de crear un Estado armenio en el norte de Azerbaiyán con el fin de utilizarlos para la intención política y la posterior expansión del Imperio zarista hacia el Cáucaso meridional y los países vecinos. Así, se formaron organizaciones terroristas nacionales en el último cuarto del siglo XIX por armenios que vivían en el extranjero. Estas organizaciones terroristas se formaron inicialmente y funcionaron como organizaciones benéficas. Los comités Hinchak y Dashnakstyun fueron las organizaciones armenias más conocidas y activas del último cuarto del siglo XIX.
Los armenios rusos crearon el Comité Hinchak (Sonido de la Campana) en Suiza en 1886-1887. El principal objetivo político del Comité era unificar a los armenios que vivían en Azerbaiyán, el Imperio Otomano y el Imperio Persa para crear una «Gran Armenia». Aunque los armenios rusos crearon el Comité en Suiza, su sede se trasladó posteriormente de Suiza a Londres, que quedó bajo la influencia del Imperio Británico.
Mientras tanto, en 1890 se creó en Tiflis (Tbilisi) el Comité Nacional Armenio de Dashnakstyun. El principal objetivo político de este Comité era unificar todos los comités y organizaciones armenios en funcionamiento para organizar una revolución contra los turcos.190 Tras la creación del Comité de Dashnakstyun, comenzaron las matanzas masivas de armenios contra la población musulmana y turca en el Imperio Otomano y Azerbaiyán. Si se observan las funciones de estos dos comités en aquella época, se puede ver que organizaron muchas revueltas y actividades subversivas en las regiones donde vivía la población musulmana y turca. La primera atrocidad perpetrada por el Comité Hinchak fue el asesinato de 65.000 civiles musulmanes (turcos y kurdos) en el sureste del Imperio Otomano entre 1890 y 1892. Además, las resistencias de Sassoun que comenzaron en 1894 y continuaron durante más de una década también fueron organizadas por estos comités.191 Estas acciones sangrientas de las organizaciones terroristas armenias también se organizaron en Azerbaiyán en 1905 y 1906.192
El primer enfrentamiento étnico de la historia entre armenios y azerbaiyanos se produjo en vísperas de la Revolución Rusa de 1905. Los sangrientos acontecimientos organizados por los armenios en febrero de ese año, utilizando la revolución como pretexto, se extendieron a las demás regiones de Azerbaiyán en poco tiempo. Karabaj se convirtió así en un foco de estos acontecimientos en 1905 y 1906. Durante ese tiempo, las unidades militares rusas con base en Karabaj y Tiflis (Tbilisi) apoyaron firmemente a los armenios en este sentido. La mayoría de las víctimas de las atrocidades armenias se encontraban en Shusha, donde los armenios mataron a miles de azerbaiyanos, que constituían aproximadamente la mitad de la población.193
En su libro «Años de sangre», Mammad Said Ordubadi ofrece información precisa sobre los sucesos de 1905-1906 entre armenios y azerbaiyanos. Como testigo presencial de los disturbios, el autor establece en su libro cuatro causas, basadas en informes de los medios de comunicación de la época, protocolos de oficiales militares rusos y cartas de denuncia de las víctimas:
En cuanto a la situación demográfica en Karabaj y el uyezd de Shusha, que cubría el territorio del actual Nagorno Karabaj, los disturbios de 1905-1906 tuvieron lugar tanto a nivel nacional como étnico. La migración y el asentamiento de armenios en Azerbaiyán procedentes de los imperios otomano y persa como resultado de la política migratoria del Imperio zarista influyeron drásticamente en la composición étnica de la población de Karabaj. La población armenia asentada en el uyezd de Shusha alcanzó el 58% de toda la población del uyezd en 1886. Según el censo de población del Imperio zarista de 1897, Karabaj tenía una población total de 415.721 personas. El 39,5 por ciento de ellos eran armenios étnicos, el uno por ciento rusos y el 59,5 por ciento restante azerbaiyanos étnicos.195 Es importante mencionar que el historiador ruso Skibitsky escribe que la población armenia del uyezd de Shusha descendió al 25 por ciento a principios del siglo XX.196. Aunque la situación demográfica en Karabaj cambió a favor de Azerbaiyán (azerbaiyanos 62%, armenios 36%) tras los sangrientos acontecimientos de 1905-1906, según el censo de 1912, la población armenia del uyezd de Shusha aumentó 197.
El citado censo de población del Imperio zarista de 1997 muestra que había aproximadamente 900.000 armenios en el Cáucaso Sur. Sin embargo, una década más tarde, el historiador ruso Shavrov escribió que el número de armenios en el Cáucaso meridional ya había alcanzado los 1,3 millones en 1911. Así pues, en unos 15 años, el número de armenios aumentó en 400 mil (45%), lo que les dio la oportunidad de politizar en gran medida sus intereses nacionales en el Cáucaso meridional. Como resultado, los armenios, como uno de los tres principales grupos étnicos que desempeñaron un papel decisivo en los procesos políticos del Cáucaso Meridional, tuvieron derecho a enviar representantes a la Duma Estatal del Imperio zarista.