A finales del siglo XVIII, el Imperio zarista utilizó la agitación política del Imperio persa como pretexto para reforzar su posición en el Cáucaso. Así, Kovalenski fue enviado a la región en 1799 para obtener información sobre cuestiones administrativas. Más tarde, el general Lazarev, general militar ruso de origen armenio, se trasladó a Georgia con el ejército ruso, lo que el resultado fue la anexión de Georgia oriental al Imperio zarista en virtud de un decreto del zar Alejandro I de 12 de septiembre de 1801. Junto con Georgia oriental, las regiones de Gazakh, Borchali, Shamshadil y Pambak de Azerbaiyán también fueron anexionadas al Imperio zarista. Este decreto marcó el inicio de la política expansionista del Imperio zarista hacia Azerbaiyán.167

En febrero de 1803, Sisianov, general militar ruso de origen georgiano, se dirigió a Tiflis (Tbilisi) con otros cincuenta mil soldados como comandante en jefe de las fuerzas militares del Imperio zarista en el Cáucaso. Uno de los ayudantes de Sisianov era el armenio Ovannes (Ivannes). Sisianov se diferenciaba de los generales anteriores por su carácter agresivo. Fue enviado con instrucciones especiales para reforzar la posición del Imperio zarista en el Cáucaso.

Estas instrucciones incluían utilizar el poder de los armenios tanto como fuera posible durante la expansión hacia el Cáucaso.168

El primer objetivo tras la ocupación del este de Georgia fue la región de Jar-Balakan de Azerbaiyán, que ocupaba una posición geográfica estratégica. Las fuerzas militares de la Rusia zarista también tenían un pretexto importante para adentrarse en Azerbaiyán desde Jar-Balakán y ocupar Daguestán. Así, el príncipe Alejandro, hijo del zar georgiano, se dirigió a Jar-Balakán para obtener ayuda en la lucha contra la política expansionista del Imperio zarista hacia el Cáucaso. Así pues, en la primavera de 1803, las fuerzas militares del Imperio zarista, bajo el mando del general Gulyakov, se dirigieron a Jar-Balakán. La batalla en el río Ganij se saldó con la victoria del general Gulyakov y la ocupación de Jar-Balakan por el Imperio zarista. Bajo los términos del “Compromiso Solemne” (también llamado “Acuerdo del Juramento”) del 12 de abril de 1803, la región de Jar-Balakan de Azerbaiyán fue anexionado al Imperio zarista y envió un rehén a Tiflis (Tbilisi) como muestra de su buena voluntad. Se establecieron bases militares rusas en la región. Jar-Balakán pagó tributo en seda al Imperio zarista y la regulación interna de la región quedó sometida a él.

El siguiente objetivo expansionista del general Sisianov era ocupar el Kanato de Ganyá, considerado un punto clave para una incursión en Azerbaiyán. La agresiva respuesta de Javad Khan, el Khan del Kanato de Ganyá, a las cartas amenazadoras del general Sisianov exigiendo que la ciudad se rindiera sin oponer resistencia condujo a la Batalla de Ganyá entre las fuerzas militares del Imperio zarista y el Kanato de Ganyá a principios de 1804. Como resultado de la Batalla de Ganyá, los días 2 y 3 de enero de 1804, Javad Khan y su hijo Huseyngulu fueron asesinados y Ganyá fue anexionada al Imperio zarista. El nombre de la ciudad pasó a ser Yelizavetpol, y todo aquel que utilizara la palabra «Ganyá» debía pagar una libra de plata como multa.

La ocupación del territorio de Azerbaiyán por el Imperio zarista influyó significativamente en sus relaciones con los imperios otomano y persa. Todos los países europeos, especialmente Inglaterra, buscaban una oportunidad de interferir para impedir que el Imperio zarista se expandiera hacia el sur, lo que era visto como una amenaza directa para sus intereses en Oriente Próximo. Así, Inglaterra instó al Imperio persa a declarar la guerra al Imperio zarista en junio de 1804 a causa de su expansión hacia el Cáucaso. Mientras tanto, las fuerzas militares del Imperio zarista iniciaron una marcha hacia Azerbaiyán bajo el mando del general Sisianov. Comenzaron a atacar Azerbaiyán desde tres direcciones diferentes: Tiflis (Tbilisi), el Cáucaso Norte y el Mar Caspio. La ocupación del Kanato de Ganyá y la trágica muerte de Javad Khan conmocionaron a otros kanatos de Azerbaiyán y no les dejaron otra alternativa que aceptar la soberanía de Rusia.

Así, los kanatos de Karabaj (14 de mayo de 1805), Shaki (21 de mayo de 1805) y Shamakhi (25 de diciembre de 1805) fueron sistemáticamente anexionados al Imperio zarista.169

A principios de 1806, las fuerzas militares del Imperio zarista, al mando del general Sisianov, rodearon la fortaleza de Bakú. Durante una reunión en febrero de 1806 con Huseyngulu Khan, el Khan del Khanato de Bakú, Sisianov fue asesinado por el sobrino de Huseyngulu Khan. Tras la muerte de Sisianov, todos los kanatos de Azerbaiyán se rebelaron contra el Imperio zarista.170 Mientras tanto, el Imperio otomano bloqueaba el Estrecho con buques de guerra debido a las actividades destructivas de Rusia en el Cáucaso y los Balcanes, lo que provocó tensiones entre ambas partes. Aunque todo estaba en conformidad con el acuerdo de 1798 entre los imperios otomano y zarista, como resultado de la intervención de Inglaterra y Francia, en octubre de 1806 estalló la guerra entre los imperios otomano y zarista.171

Sin embargo, el Imperio zarista no renunció a su intención de ocupar Azerbaiyán, aunque luchaba en dos frentes diferentes contra los imperios otomano y persa. Mientras tanto, se produjeron rebeliones locales de los kanatos de Azerbaiyán contra el Imperio zarista, que más tarde fueron reprimidas

sin piedad. El 10 de junio de 1804, Ibrahimkhalil Khan, el kan del kanato de Karabaj, fue asesinado en Khankendi, junto con 17 miembros de su familia. Esta acción provocó una rebelión en el janato de Shaki por parte de Salim Khan, que logró destruir la guarnición del Imperio zarista cerca del janato de Shaki. Sin embargo, la rebelión de Shaki Khanate también fue reprimida por las fuerzas militares del Imperio zarista, y Salim Khan escapó al Imperio persa. Como resultado, el Imperio zarista ocupó las ciudades de Ganja, Shusha, Shamakhi, Iravan, Nakhchivan, Guba, Darband, Bakú, Rasht y Anzali hasta 1811.172

Tras la ocupación del kanato de Lankaran por el Imperio zarista en diciembre de 1812, el Imperio persa admitió su derrota. El 24 de octubre de 1813 se firmó un tratado de paz entre los imperios zarista y persa en Gulistan, un pueblo de Karabaj. Como resultado del Tratado de Gulistan, el territorio histórico de Azerbaiyán se dividió en dos partes: el norte (excepto Iravan y Najicheván) se anexionó al Imperio zarista, y el sur permaneció en el Imperio persa. Este Tratado concluyó la primera parte de la división del territorio de Azerbaiyán entre los imperios zarista y persa.

El Tratado de Gulistan constaba de 11 artículos. Los artículos II y III definían las fronteras entre las partes. El Imperio persa reconocía la soberanía del Imperio zarista sobre el norte de Azerbaiyán (excepto los kanatos de Iraván y Najicheván), incluidos los janatos de Ganyá, Karabaj, Shaki, Shirván, Guba, Bakú y Lankarán, junto con el sur de Daguestán y el este de Georgia. Según el artículo V, el Imperio zarista tenía el derecho exclusivo de disponer de buques de guerra en el mar Caspio. Los artículos VIII, IX y X trataban de cuestiones comerciales y aduaneras. Cabe destacar que cuando el zar del Imperio zarista estaba a punto de firmar los documentos oficiales del Tratado de Gulistan, se hizo evidente que había un error en el texto del Tratado, ya que los kanatos de Karabaj y Ganyá no se mencionaban entre los territorios que debían ser entregados al Imperio zarista según los términos del Tratado de Gulistán. Por lo tanto, en enero de 1814, los documentos del Tratado fueron devueltos al Imperio persa y no fueron ratificados hasta el 28 de julio de 1818.173